Класиралите се от първия кръг на турнира 16 отбора чрез пълен жребий ще определят осем двойки. Според регламента победителите ще се излъчат по системата на отстраняване в една футболна среща, като домакин на футболната среща е отборът, изтеглен първи на жребия.
Мачовете ще се играят на 25, 26 и 27 октомври 2016 г.
Ето кои отбори стигнаха до тази фаза:
Лудогорец, Левски, Локо (Пд), Нефтохимик, Пирин (Бл), Верея, Монтана, Локо (Сф), Септември (Сф), Черно море, Ботев (Пд), Дунав (Русе), Поморие, Созопол, Литекс, Оборище (Панагюрище).
| | |||||||||||||||||