Базирайки се на резултатите от одита и показаното ниво на развитие на системата, одиторският екип препоръчва убедително сертификацията на системата да бъде разрешена. 

МУ-Пловдив е първият медицински университет у нас, който въвежда и поддържа система за управление на качество по стандарт ISO-9001 още от 2009 година.

Стандартът означава разработване и внедряване на единна ефективна система за управление на качеството на всички нива на предлаганата услуга - висше медицинско образование. 

С въвеждане на системата за управление на качеството по ISO-9001 се гарантира пред студенти, докторанти, специализанти и обществото, че образованието, което предлага университетът, е в съответствие с националните и международните стандарти и разпоредби.